És Professor d'Investigació del CSIC. Actualment és director de l'Institut de Ciències de l'Espai (CSIC – IEEC) i ha estat fundador de l'Institut d'Estudis Espacials de Catalunya (IEEC).

Jordi Isern és especialista en Astrofísica i ha treballat en les últimes etapes de l'evolució estel·lar, més concretament en la física de les estrelles nanes blanques i en les explosions de supernoves. També ha treballat sobre l'origen dels elements químics. Ha estat co – editor de la revista científica Europhysics Letters, president de l'Associació de Campus Afiliats de la ISU(International Space University) i actualment és president del Comitè Científic de l'Observatori Hispà – Alemany de Calar Alto.

És membre del Consell Assessor de Recerca en Acció.